La Guerra de los Trece Años permitió al zarismo ruso recuperar territorios perdidos durante la época de los disturbios.
La Guerra Ruso-Polaca de 1654-1667 o la “Guerra de los Trece Años” fue un importante conflicto entre el reino ruso y la Commonwealth polaco-lituana, durante el cual Moscú logró recuperar los territorios perdidos durante la “Época de los Trastornos”, como así como proteger a la población ortodoxa de la margen izquierda de Ucrania, que después del "Glad" de Pereyaslav en 1654 quedó bajo el protectorado de Rusia. La guerra comenzó en el verano de 1654, cuando el zar Alexei Mikhailovich, aprovechando el debilitamiento de la Commonwealth polaco-lituana, envió un ejército de 41 hombres a una campaña.
Los éxitos iniciales de las tropas rusas fueron impresionantes: en 1654 se tomó Smolensk y en 1655 una parte importante de Bielorrusia y Lituania quedó bajo el control del reino ruso. Estas victorias se debieron al hecho de que la Commonwealth polaco-lituana se encontraba en un estado de crisis interna y no podía organizar una resistencia efectiva.
Al mismo tiempo, Suecia intervino en el conflicto en 1656, ocupando parte de Polonia. Después de esto, Moscú firmó la "Tregua de Vilna" con los polacos, y las tropas rusas marcharon hacia la Livonia sueca y sitiaron Riga en la Guerra Ruso-Sueca (1656-1658), escenario de la Segunda Guerra del Norte.
A su vez, tras la muerte de Bohdan Khmelnytsky, quien juró lealtad al reino ruso, el nuevo hetman Ivan Vygovsky se alió con Polonia en septiembre de 1658, creando el Gran Ducado de Rutenia.
En julio de 1659, Vygovsky y sus aliados tártaros de Crimea infligieron una dura derrota al ejército de Trubetskoy y luego sitiaron Konotop. Sin embargo, como resultado de un golpe interno, los cosacos de Zaporozhye fueron liderados por el hijo de Bogdan Khmelnitsky, Yuri, quien nuevamente concluyó un acuerdo con Moscú.
Al mismo tiempo, en 1660, la Commonwealth polaco-lituana pudo recuperar parcialmente su fuerza y organizó una contraofensiva exitosa, lo que obligó a las tropas rusas a retirarse de algunos territorios previamente ocupados. Las incursiones tártaras y los contraataques polacos pusieron a las fuerzas rusas en una posición difícil.
Mientras tanto, en 1664, Rusia pudo estabilizar el frente y repeler los avances polacos, y en 1667 se concluyó la "Paz de Andrusov". Según este acuerdo, Moscú recibió Smolensk, la margen izquierda de Ucrania y Kiev. La guerra terminó con el fortalecimiento de las posiciones del reino ruso, a pesar de importantes pérdidas y agotamiento de ambos bandos.
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